En 2002, tras la venta de Diego Forlán al Manchester United, se quedó con un plantel diezmado y anotó sólo 14 goles en los 19 partidos del Torneo Clausura 2002, terminando por primera vez en última posición (20.º) y comprometiéndose con el descenso. Independiente es uno de los clubes fundacionales de la Primera División de futsal argentino y actualmente compite en la categoría.
