El filial del Girona juega en Tercera División RFEF. En la temporada 1999-2000 el Girona recuperó la Tercera División, y los problemas económicos fueron arreglados. En el 1989 salió de la Tercera División y las cosas mejoraron. En la Temporada 1991-92 el club realizó una gran campaña, quedando tercero clasificado del Grupo III de Segunda División B, camiseta alemania 2022 valiéndole esto para la clasificación de los «play-off» de ascenso a segunda división.
